Abb. 4.13 Für den Beitrag einer Salzbrücke zur Bindungsaffinität ist entscheidend, in welcher Umgebung diese Salzbrücke ausgebildet wird. Im Thrombin (links) führt die Einführung einer Benzamidingruppe 4.8ð4.9 tief vergraben in der S1-Tasche zur Ausbildung einer Salzbrücke mit Asp 189. Der Affinitätsgewinn ist sehr groß (s. Abb. 4.11c). In der t-RNA Guanin-Transglycosylase bringt das Anfügen einer Carboxylatgruppe an den terminalen Phenylring 4.11ð4.12 keine Affinitätssteigerung des nanomolar bindenden 4.11. Die Kristallstruktur beweist zwar, dass die Salzbrücke zu Arg 286 geometrisch gebildet wird, da sie aber weitgehend zum umgebenden Lösungsmittel exponiert verbleibt, ist ihr Beitrag verschwindend gering. :