Abb. 23.6 Allgemeiner Bindungsmodus einer zu spaltenden Peptidkette (graue Kohlenstoffatome) im katalytischen Zentrum einer Serinprotease. Die zu spaltende Amidbindung ist in gelb dargestellt. Der P1-Rest (hellblau) und der P2-Rest (grün) des Substrats werden mit einer Oberfläche hervorgehoben. Sie binden in die S1- und S2-Taschen des Proteins. Zur Hauptkette der Protease werden zwei antiparallel zueinander angeordnete Wasserstoffbrücken ausgebildet (grün). Die H-Brücken zum O–-Loch sind in violett und die Angriffsrichtung des nucleophilen Sauerstoffatoms von Serin 195 auf den Carbonylkohlenstoff ist in blauviolett angedeutet. :